?????? 為有效發揮協同創新和綜合管理服務職能，云南省科學技術院總部設6個內設機構，分別為：綜合管理辦公室、對外合作辦公室、科技管理辦公室、生物醫藥中心、高新技術中心、科技服務中心。

綜合管理辦公室：負責日常行政工作、黨群工作、人事工作、財務工作、宣傳教育、資產管理、安全保密、后勤保障、老干部工作。

對外合作辦公室：負責支撐服務科技入滇、對外科技交流合作、科技孵化器建設和管理等工作。

科技管理辦公室：負責相關科技項目的組織策劃、實施和管理工作。

生物醫藥中心：負責支撐促進省生物醫藥和大健康產業發展工作。

高新技術中心：負責支撐服務工業化、信息化、現代服務業發展和中小企業相關項目工作。

科技服務中心：負責支撐服務科技平臺建設、創新人才培養引進等相關工作。